Composé alcaloïde présent naturellement dans de nombreuses plantes comme l'épine-vinette (Berberis vulgaris), l'hydraste du Canada (Hydrastis canadensis) ou le raisin d'Oregon (Berberis aquifolium), l'écorce de la racine étant la partie de ces plantes ayant la plus forte teneur en berbérine.
L'écorce de la racine de ces plantes a la plus forte teneur en berbérine